Misi SMAN 3 Payakumbuh:

Untuk mewujudkan visi, SMA Negeri 3 Payakumbuh memiliki misi sebagai berikut.

1. Meningkatkan iman dan taqwa (Imtaq) seluruh warga SMA Negeri 3 Payakumbuh.

2. Mewujudkan proses pembelajaran PAIKEM (Pendidikan Aktif, Inovatif, Kreatif, Efektif, dan Menyenangkan).

3. Menanamkan dan mengaplikasikan nilai-nilai budi pekerti dan nilai-nilai luhur bangsa dalam kehidupan sehari-hari.

4. Melaksanakan pendidikan karakter secara terintegrasi ke setiap mata pelajaran.

5. Menyiapkan peserta didik untuk siap berkompetisi di bidang akademik dan non akademik di tingkat lokal maupun global.

6. Menyiapkan peserta didik untuk melanjutkan pendidikan ke perguruan tinggi yang terakreditasi.

7. Menciptakan iklim sekolah yang kondusif sebagai tempat berlangsungnya proses pembelajaran.

8. Menerapkan Teknologi Informasi dan Komikasi (TIK) dalam proses pembelajaran dan pengelolaan sekolah.

9. Meningkatkan kompetensi pendidik dan tenaga kependidikan.

10. Menciptakan lingkungan sekolah yang asri melalui penerapan Pendidikan Berbasis Keunggulan Lokal (PBKL).

11. Meningkatkan kesadaran warga sekolah tentang prilaku hidup bersih dan sehat.

12. Melaksanakan inovasi secara berkesinambgan sebagai salah satu sekolah pelaksana PBKL dan PSB di Sumatera Barat.